Het Machtigingenregister Digipoort bevat een overzicht van organisaties waarvoor machtigingen zijn verstrekt voor het digitaal ophalen van berichten en gegevens. Dit geldt voor diverse klanten, zoals bedrijven en particulieren. Een machtiging kan enkel worden verleend als de klant hier expliciet toestemming voor heeft gegeven. Daarnaast is het altijd mogelijk om een machtiging weer in te trekken.
Medewerkers van organisaties hebben nu de mogelijkheid om machtigingen in te zien of in te trekken, mits deze geregistreerd zijn onder het fiscale nummer van de organisatie of het Kamer van Koophandel-nummer. Bovendien kunnen intermediairs en hun medewerkers ook machtigingen beheren, zolang deze zijn geregistreerd op het Rechtspersonen en Samenwerkingsverbanden Informatienummer (RSIN) van de intermediair.
Als medewerkers van organisaties of intermediairs een machtiging willen inzien of intrekken, moeten ze eerst inloggen via eHerkenning bij Logius via het Machtigingenregister Digipoort.